二是內部組織架構。進出口業務、財務、貿易安全、內部審計等部門（崗位）職責分工明確并有效落實。指定高級管理人員負責關務。
三是單證控制。要求建立進出口單證復核或者糾錯制度并有效落實。
五是進出口活動。建立進出口活動的流程管理制度。
六是內審制度。建立對進出口活動的內部審計制度并有效落實。每年實施1次以上的內部審計并建立書面或者電子資料的檔案。已成為高級認證企業的，應當每年對持續符合海關高級認證企業標準實施內部審計。
八是改進機制。對海關要求的改正或者規范改進等事項，應當由法定代表人（負責人）或者負責關務的高級管理人員組織實施。
九是信息系統。即具有管理企業生產經營活動的信息化系統。
十是數據管理。建立信息系統的數據管理制度，數據存儲3年以上。
